Работа Excel в качестве сервиса, официально более не поддерживается Microsoft https://support.microsoft.com/en-us/kb/257757#kb2
Microsoft does not currently recommend, and does not support, Automation of Microsoft Office applications from any unattended, non-interactive client application or component (including ASP, ASP.NET, DCOM, and NT Services), because Office may exhibit unstable behavior and/or deadlock when Office is run in this environment.
Это ограничение снято в Энергосфера 8.0, использованием другой библиотеки.
Для версии Энергосферы 7.1 и ниже воспользуйтесь следующей инструкцией:
1)Выдать учетной записи от которой работает служба полные разрешения на следующие каталоги:
"C:\Windows\SysWOW64\config\systemprofile\AppData\Roaming"
"C:\Windows\SysWOW64\config\systemprofile\AppData\Local"
"C:\Windows\SysWOW64\config\systemprofile\Desktop"
"C:\Windows\SysWOW64\config\systemprofile\AppData\Local\Microsoft\Windows\Temporary Internet Files"
(с поправкой на расположение каталога Windows)
Также, в некоторых случаях, требуется аналогичные права раздать на каталоги
"C:\Windows\system32\config\systemprofile\AppData\Roaming"
"C:\Windows\system32\config\systemprofile\AppData\Local"
"C:\Windows\system32\config\systemprofile\Desktop"
(с поправкой на расположение каталога Windows)
2)Запустить procmon или аналог и фильтровать события по результату "ACCESS DENIED" и процессам expimp.exe и Excel.exe (лучше сначала выполнить предыдущие шаги). Дать права на доступ ко всему что в этом списке появится.